More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4619 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  100 
 
 
389 aa  788    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  57.18 
 
 
390 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  56.12 
 
 
391 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  55.36 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  53.33 
 
 
405 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  54.09 
 
 
401 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  49.4 
 
 
417 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  40 
 
 
410 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
388 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 
396 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 
396 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 
398 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 
411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 
396 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  37.63 
 
 
392 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  38.32 
 
 
394 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 
394 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  36.53 
 
 
395 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 
401 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
402 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 
397 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 
392 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  34.51 
 
 
403 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  36.2 
 
 
405 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
386 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
400 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  34 
 
 
414 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
377 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  34.55 
 
 
409 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.23 
 
 
395 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 
419 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
446 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  30.99 
 
 
427 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
424 aa  202  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  33.44 
 
 
431 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
413 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  31.03 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  30.83 
 
 
402 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  35.55 
 
 
419 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 
399 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.27 
 
 
404 aa  192  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  33.44 
 
 
411 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 
364 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 
402 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
410 aa  186  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 
412 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
350 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
436 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 
419 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
439 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  30.38 
 
 
403 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
404 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
406 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
406 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.53 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 
395 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 
402 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  35.71 
 
 
424 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
372 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
441 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
395 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 
369 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 
389 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 
370 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 
341 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
373 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
372 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
373 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
346 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
364 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 
304 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 
369 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
448 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 
360 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
377 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
349 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  32.51 
 
 
304 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
366 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
356 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 
350 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
366 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 
436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 
349 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>