More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0187 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0187  HDIG  100 
 
 		 401 aa  826    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  61.92 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  62.75 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  61.32 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  57.42 
 
 		 409 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  55.29 
 
 		 431 aa  471  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  54.86 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  56.31 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  54.2 
 
 		 419 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  53.62 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  55.06 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  55.97 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  56.03 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  52.38 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  52.11 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  52.59 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  49.63 
 
 		 419 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  48.56 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  61.27 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  45.09 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  45.2 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  44.91 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  41.33 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  39.85 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 424 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 		 429 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  37.73 
 
 		 304 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  38.34 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  33.42 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 394 aa  222  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 		 402 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  33.43 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.8 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  34.3 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  32.62 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  32.93 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 398 aa  212  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.64 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 		 398 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.15 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  31.87 
 
 		 401 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 		 350 aa  200  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  31.03 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 		 395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  31.88 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.99 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  32.11 
 
 		 443 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  28.24 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 366 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 		 372 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 370 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 		 349 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  31.51 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  35.66 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>