More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0739 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
411 aa  848    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  57.49 
 
 
419 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  55.9 
 
 
431 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  57.11 
 
 
399 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  56.48 
 
 
413 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  56.66 
 
 
409 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  56.31 
 
 
401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  56.02 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  52.7 
 
 
414 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  52.33 
 
 
419 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  52.33 
 
 
403 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  53.28 
 
 
410 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  52.8 
 
 
402 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  53.19 
 
 
427 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  51.84 
 
 
402 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  49.88 
 
 
395 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  48.45 
 
 
419 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  49.39 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  58.28 
 
 
372 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  43.14 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 
406 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  41.65 
 
 
404 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  40.2 
 
 
395 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 
413 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  38.65 
 
 
400 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
402 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 
429 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
404 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
377 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 
386 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 
304 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  36.83 
 
 
304 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  34.89 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
439 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  36.8 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.97 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
319 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30 
 
 
410 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
388 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
401 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
396 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
398 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 
411 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.44 
 
 
389 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
411 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
396 aa  190  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.82 
 
 
394 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 
390 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  34.28 
 
 
405 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 
401 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  28.23 
 
 
392 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
364 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
394 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
392 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
400 aa  186  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  28.87 
 
 
405 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  33.77 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
441 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
448 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  34.89 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  29.37 
 
 
403 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
396 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
396 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
396 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
417 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
372 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 
364 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30.41 
 
 
424 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
395 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  34.89 
 
 
366 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
457 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
370 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 
369 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 
362 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  32.27 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
373 aa  163  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 
394 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  34.86 
 
 
453 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
350 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
377 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  26.93 
 
 
435 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  28.46 
 
 
488 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 
360 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>