More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2150 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
364 aa  744    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  45.58 
 
 
389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  42.98 
 
 
373 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  41.46 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 
370 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 
369 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
388 aa  294  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
366 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
366 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 
364 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 
356 aa  265  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  39.94 
 
 
353 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
373 aa  252  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  40.06 
 
 
352 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
369 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
350 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
359 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 
360 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
401 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.2 
 
 
424 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  35.95 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
386 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1293  metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 
335 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  31.5 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
402 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 
402 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  32.85 
 
 
394 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
396 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 
392 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 
411 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 
398 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  37.97 
 
 
389 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
396 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
411 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 
411 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 
394 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
396 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  37.87 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
396 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.99 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  32.24 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
413 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
399 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 
396 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  34.98 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 
412 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 
446 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
400 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
436 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  35.47 
 
 
427 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  36.89 
 
 
392 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
377 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  35.86 
 
 
402 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
397 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
419 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 
401 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
439 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 
448 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  37.14 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 
457 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 
448 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.44 
 
 
390 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 
436 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 
405 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  35.32 
 
 
409 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  30.56 
 
 
453 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 
346 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
401 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
398 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 
403 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
400 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  37.05 
 
 
448 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 
402 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 
410 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 
391 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
400 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4158  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
348 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
393 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  31.9 
 
 
395 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 
395 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
388 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3878  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3932  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
436 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  31.12 
 
 
404 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  35.16 
 
 
443 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 
404 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
362 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.99 
 
 
419 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
435 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>