More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3275 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 448 aa  897    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  59.16 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  51.97 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  46.61 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  47.2 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  40.28 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0251  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000543923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 		 364 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0235  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  35.02 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 		 369 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.83 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.22 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 		 377 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  31.92 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 		 398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  35.46 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2817  metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 		 372 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  34.81 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  34.96 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  34.33 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  34.6 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  34.02 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  32.59 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.63 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0699  HD domain-containing protein  31.89 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 369 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 		 401 aa  146  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  35.42 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  37 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.61 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  30.72 
 
 		 394 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  32.98 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  31.19 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  34.78 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1179  HD-GYP domain-containing protein  28.23 
 
 		 380 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 411 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 		 441 aa  140  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 411 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  30.88 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  32.16 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 		 372 aa  136  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.04 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>