More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1894 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  712    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0647  HD-GYP domain-containing protein  32.28 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0194501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0007  metal dependent phosphohydrolase  31.64 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 356 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  30.72 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0007  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000616807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0746  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 384 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  29.18 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 388 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 		 411 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 331 aa  146  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 506 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 448 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.05 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  32.82 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  31.79 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  32.57 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.2 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 		 431 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.1 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 		 698 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 436 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  35.91 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 397 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  27.89 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3878  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  45.12 
 
 		 713 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 		 451 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 		 1073 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 		 430 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 		 495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  26.85 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  41.61 
 
 		 574 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 		 451 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  34.89 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 615 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 448 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 487 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>