More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0101 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
360 aa  740    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0746  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
384 aa  332  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3878  metal dependent phosphohydrolase  39.94 
 
 
362 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
345 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
346 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
349 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0007  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0007  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
359 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000616807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
350 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
373 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
386 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
388 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
360 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.9 
 
 
410 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
364 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0647  HD-GYP domain-containing protein  27.15 
 
 
340 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0194501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  25.14 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
370 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  35.93 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
411 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 
373 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 
439 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.84 
 
 
404 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 
379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
366 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 
366 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 
399 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  28.41 
 
 
405 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
401 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 
395 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 
359 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 
392 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.77 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  26.15 
 
 
392 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.33 
 
 
401 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 
372 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 
364 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.82 
 
 
880 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  34 
 
 
402 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.82 
 
 
860 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  32.7 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  29.82 
 
 
453 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
411 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  37.25 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
358 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
396 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 
446 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
402 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
436 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
431 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  34.59 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
1073 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0886  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.286498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  41.41 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  26.26 
 
 
394 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
413 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 
492 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
441 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
516 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 
718 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 
400 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  38.51 
 
 
453 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  29.89 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.04 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  28.09 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  32.5 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  31.96 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.56 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  35.61 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>