More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2515 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  817    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  84.86 
 
 		 403 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  86.57 
 
 		 402 aa  689    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  55.83 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  55.1 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  53.77 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  53.58 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  52.8 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  52.69 
 
 		 399 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  54.03 
 
 		 410 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  52.22 
 
 		 409 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  55.09 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  51.99 
 
 		 395 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  51.86 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  55.64 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  50.25 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  49.27 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  45.37 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  47.72 
 
 		 404 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  46.21 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  46.56 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  55.45 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  45.54 
 
 		 446 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  44.75 
 
 		 413 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  42.75 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 		 424 aa  252  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.05 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 439 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 304 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 436 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  37.53 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  31.33 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 401 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.17 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  31.13 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  31.18 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  30.57 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.87 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  31.76 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 		 350 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  27.61 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  29.47 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  36.05 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  35.86 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  39 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  27.99 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 360 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 421 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  45.81 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>