More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2783 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  84.86 
 
 		 402 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 403 aa  817    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  95.78 
 
 		 402 aa  753    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  52.85 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  54.32 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  52.57 
 
 		 411 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  52.12 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  53.1 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  52.18 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  52.43 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  53.2 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  54.81 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  52.46 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  55 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  49.02 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  48.27 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  47.39 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  45.02 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  45.68 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  46.19 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  46.06 
 
 		 403 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  53.85 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  43.99 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  43.15 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 		 413 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  35.93 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 406 aa  229  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 377 aa  227  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  33.6 
 
 		 439 aa  222  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.24 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  34 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 		 319 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.09 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  35.17 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 394 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  30.73 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  30.79 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 		 401 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 397 aa  192  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.69 
 
 		 410 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  35.82 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  31.96 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  29.76 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  35.74 
 
 		 443 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  29.72 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 448 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  35.1 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 441 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  39.57 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  46.37 
 
 		 539 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>