More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1451 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
366 aa  751    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 
373 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  45.51 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  41.39 
 
 
370 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 
364 aa  295  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 
373 aa  285  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
364 aa  268  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  38.72 
 
 
377 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
369 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 
353 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
356 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 
350 aa  225  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 
359 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 
352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
350 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
388 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
356 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
360 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
345 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 
413 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 
346 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
424 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 
436 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
431 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  38.36 
 
 
424 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
448 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 
399 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.91 
 
 
409 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 
406 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
400 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
410 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.06 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
402 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
401 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
393 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  28.69 
 
 
401 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  36.03 
 
 
419 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 
402 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  30.72 
 
 
352 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
388 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 
412 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.48 
 
 
390 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  30.18 
 
 
403 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
403 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 
446 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  29.71 
 
 
405 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  27.64 
 
 
427 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  36.62 
 
 
402 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 
394 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
448 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.33 
 
 
395 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
395 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
419 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
401 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 
390 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 
400 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
386 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  29.16 
 
 
410 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  32.31 
 
 
414 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 
398 aa  153  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
417 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
411 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 
377 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  33.99 
 
 
439 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 
398 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  36.55 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.59 
 
 
394 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 
448 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1293  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
335 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  31.4 
 
 
403 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
396 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 
349 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
397 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  34.55 
 
 
419 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
396 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
479 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  30.94 
 
 
392 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 
396 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  31.92 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2039  metal dependent phosphohydrolase  40.12 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 
574 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  31.92 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  29.75 
 
 
367 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0235  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
478 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
400 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
391 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>