More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3878 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3878  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
362 aa  753    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0746  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
384 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  39.94 
 
 
360 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 
345 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
346 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
349 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
373 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0647  HD-GYP domain-containing protein  29.25 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0194501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
356 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 
350 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
369 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 
356 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 
350 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0007  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
359 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000616807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
369 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
373 aa  142  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 
436 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  29.31 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  25.69 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
360 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  35.92 
 
 
401 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
359 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 
448 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0007  metal dependent phosphohydrolase  23.92 
 
 
355 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
413 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 
377 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
412 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  27.87 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
406 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 
366 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.36 
 
 
390 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
398 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
402 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
643 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  35.14 
 
 
424 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  32.55 
 
 
403 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.57 
 
 
427 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 
386 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 
411 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
446 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
388 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 
402 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 
643 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.58 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 
643 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 
643 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 
642 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 
643 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
377 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 
632 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
319 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 
395 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  31.05 
 
 
421 aa  118  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  34.09 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
496 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
642 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 
398 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 
642 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 
199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  26.96 
 
 
395 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  31.16 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
411 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
411 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
397 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
431 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
1073 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 
448 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  25 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 
403 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  41.86 
 
 
545 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 
304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  31.6 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
652 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  30.54 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>