More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03089 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  100 
 
 
395 aa  808    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  40.5 
 
 
410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 
388 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  36.53 
 
 
389 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
402 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
390 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
398 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 
400 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
391 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
405 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 
401 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  35.99 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
401 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
398 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
394 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.82 
 
 
392 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
417 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
396 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
400 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
411 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
396 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
396 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  33.16 
 
 
394 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
396 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  32.58 
 
 
403 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  31.09 
 
 
405 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 
400 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
402 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
401 aa  186  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.32 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
404 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
424 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  28.24 
 
 
401 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 
448 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 
436 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.17 
 
 
409 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
419 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  28.72 
 
 
402 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  29.87 
 
 
427 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  29.38 
 
 
403 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 
413 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 
377 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  28.13 
 
 
414 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
446 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 
389 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 
364 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
406 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  28.75 
 
 
419 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 
448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 
431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 
516 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  26.33 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 
439 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  27.82 
 
 
419 aa  162  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
359 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
395 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  24.33 
 
 
395 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
399 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 
395 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 
369 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 
350 aa  155  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 
429 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 
346 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
352 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 
373 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
441 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
366 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.25 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
411 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 
356 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 
353 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  31.53 
 
 
424 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
377 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
370 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
369 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.21 
 
 
488 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
349 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  26.24 
 
 
420 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 
373 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  27.12 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>