More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1502 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
377 aa  769    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  64.36 
 
 
388 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  41.46 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 
389 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
373 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
369 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 
369 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  38.72 
 
 
366 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
370 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 
356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
364 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 
353 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 
350 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
352 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
356 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 
360 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  31.58 
 
 
427 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  26.93 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
448 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  29.41 
 
 
410 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
436 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  35.17 
 
 
448 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
411 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  29.94 
 
 
352 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  29.19 
 
 
414 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 
424 aa  156  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 
419 aa  156  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.54 
 
 
409 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  29.18 
 
 
401 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
390 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
386 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
412 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
435 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 
410 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1293  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  31.36 
 
 
402 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 
439 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 
436 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  33.6 
 
 
388 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
436 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
417 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 
419 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  28.42 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 
377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  30.23 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  31.1 
 
 
453 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  27.83 
 
 
395 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
400 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 
441 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 
372 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 
413 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  25.65 
 
 
404 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
346 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  28.34 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
402 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
395 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0007  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
359 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000616807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  32.62 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  28.37 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3932  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0007  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
355 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 
404 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 
406 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.51 
 
 
390 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
357 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  29.35 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3878  metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 
362 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  33.33 
 
 
424 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  27.69 
 
 
403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>