More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3998 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 436 aa  882    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  95.64 
 
 		 436 aa  842    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  49.33 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  46.61 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  45.39 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  38.02 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 		 350 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  35.61 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 431 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  32.15 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 		 364 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  34.75 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.22 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 		 413 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  39.01 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 412 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  34.52 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  31.94 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  35.98 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  33.76 
 
 		 350 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  31.74 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  32.36 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.27 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 		 439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  33.86 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 		 362 aa  143  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.41 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  31.16 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2817  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  30.22 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0251  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000543923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0699  HD domain-containing protein  33.73 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  30.27 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 373 aa  136  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0235  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 		 366 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  29.34 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  29.41 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2039  metal dependent phosphohydrolase  29.4 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 395 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0007  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  40.61 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  34.67 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0007  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000616807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 394 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 441 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 		 326 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>