More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0688 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
479 aa  982    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0235  metal dependent phosphohydrolase  38.97 
 
 
478 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0251  metal dependent phosphohydrolase  38.87 
 
 
478 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000543923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 
457 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
419 aa  158  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 
399 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.4 
 
 
404 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  34.75 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 
436 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 
402 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 
411 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
350 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
373 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  32.34 
 
 
443 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
401 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
448 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
436 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  31.65 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  30.93 
 
 
427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  35.46 
 
 
389 aa  146  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  31.49 
 
 
402 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  30.85 
 
 
401 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
370 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 
448 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
393 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
419 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.29 
 
 
409 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
412 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.23 
 
 
390 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
431 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
436 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
366 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  31.43 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
373 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 
410 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 
377 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
406 aa  136  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
366 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
364 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
346 aa  133  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0699  HD domain-containing protein  28.27 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  31.73 
 
 
419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1179  HD-GYP domain-containing protein  26.68 
 
 
380 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
424 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  24.2 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  32.79 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
401 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 
349 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2817  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 
372 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 
394 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
400 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
395 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
369 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  28.46 
 
 
403 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.84 
 
 
397 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 
404 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 
359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  26.21 
 
 
394 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
411 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  27.36 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  27.68 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 
350 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  29.22 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
398 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 
435 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  29.76 
 
 
488 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
396 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  34.15 
 
 
352 aa  117  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 
390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  27.43 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
404 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
406 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
435 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 
360 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 
396 aa  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
388 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 
396 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>