More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2680 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  100 
 
 		 488 aa  1006    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  43.18 
 
 		 435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 406 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.92 
 
 		 436 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0622  alkaline phosphatase  29.63 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  34.79 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.03 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 401 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 404 aa  173  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  31.01 
 
 		 410 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 350 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 386 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.07 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 		 396 aa  157  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 431 aa  156  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  28.79 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  32.79 
 
 		 405 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.61 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  27.92 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 413 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  26.95 
 
 		 395 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  27.82 
 
 		 404 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 419 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  24.46 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  27.01 
 
 		 403 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 413 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  26.11 
 
 		 395 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  23.66 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 421 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 		 389 aa  133  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 402 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  26.15 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.17 
 
 		 427 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  27.59 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  29.44 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  25.67 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  26.67 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  29.88 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  23.87 
 
 		 419 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 391 aa  123  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 420 aa  123  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>