More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2258 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  90 
 
 
420 aa  785    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
420 aa  858    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  90 
 
 
420 aa  779    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  90 
 
 
421 aa  780    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  89.29 
 
 
420 aa  781    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  89.76 
 
 
420 aa  777    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  89.52 
 
 
420 aa  782    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  90.71 
 
 
420 aa  787    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  89.76 
 
 
420 aa  777    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  67.62 
 
 
421 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  65.64 
 
 
419 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  65.24 
 
 
418 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  65.71 
 
 
421 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  61.61 
 
 
419 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  61.97 
 
 
426 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  62.65 
 
 
416 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  43.91 
 
 
417 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  43.48 
 
 
417 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  42.72 
 
 
416 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
431 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  35.28 
 
 
417 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
435 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
404 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  30.18 
 
 
446 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
454 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
398 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  31.2 
 
 
406 aa  203  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
401 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  29.83 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 
401 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
400 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
401 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.24 
 
 
466 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 
448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
402 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.58 
 
 
436 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 
406 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 
411 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
410 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  26.37 
 
 
409 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 
448 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
419 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
412 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 
413 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.52 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  26.5 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
400 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
373 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
448 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  24 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 
399 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.82 
 
 
390 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
406 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
369 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  25.85 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  25.2 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  23.34 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.74 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  26.75 
 
 
395 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 
350 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  25.61 
 
 
403 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
446 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  23.19 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  24.8 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  24.3 
 
 
395 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  23.95 
 
 
488 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 
350 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 
393 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 
435 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 
457 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 
349 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  27.76 
 
 
398 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
390 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>