More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2511 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  911    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  51.5 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 		 454 aa  335  9e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  43.49 
 
 		 448 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  41.77 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  36.95 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 		 418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  32.49 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  29.84 
 
 		 417 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 420 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 		 420 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  27.94 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  28.87 
 
 		 416 aa  216  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  29.1 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  25.92 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  28.41 
 
 		 406 aa  150  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  25.06 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  26.18 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 401 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  23.88 
 
 		 401 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  27.48 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  28.11 
 
 		 488 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 353 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  25.72 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.43 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 		 411 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.3 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  27.32 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  32.13 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  28.12 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  28.17 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 350 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.84 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  23.56 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  29.92 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  24.28 
 
 		 406 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  23.95 
 
 		 446 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  24.08 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0251  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000543923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>