More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2333 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  873    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  68.09 
 
 		 416 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  62.21 
 
 		 421 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  61.97 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  61.5 
 
 		 420 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  61.5 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  61.5 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  61.27 
 
 		 420 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  61.27 
 
 		 420 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  61.27 
 
 		 420 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  61.27 
 
 		 420 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  60.09 
 
 		 419 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  59.58 
 
 		 418 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  61.03 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  56.57 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  56.94 
 
 		 421 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  46.19 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  45.24 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  44.52 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  27.71 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 398 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  30.44 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 		 466 aa  202  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  30.79 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  27.34 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  31.83 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.58 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 		 406 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.73 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  25.14 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  25.14 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  33.76 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.57 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 		 353 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  24.86 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  26.33 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  24.13 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 350 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  25.06 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25.72 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  24.43 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  26.74 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 402 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  25.51 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  23.51 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  26.38 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  27.51 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  26.89 
 
 		 392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 364 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  24.23 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  27.52 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 369 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  25.06 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>