More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2630 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 435 aa  886    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  51.16 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  45.35 
 
 		 454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 		 448 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 		 418 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  31.89 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 		 421 aa  236  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  31.18 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  30.48 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  30.94 
 
 		 420 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 420 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  31.08 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 421 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  28.92 
 
 		 406 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  27.76 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  25.24 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.93 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 401 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 402 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  33.5 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.76 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  35.52 
 
 		 424 aa  123  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.82 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.49 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.13 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.84 
 
 		 410 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.08 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  25.31 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.15 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  30.69 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 446 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.34 
 
 		 401 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  23.26 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 366 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 390 aa  106  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.15 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  28.07 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2262  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  29.02 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>