More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2351 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 421 aa  865    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  70.55 
 
 		 421 aa  631  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  68.1 
 
 		 420 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  67.3 
 
 		 418 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  67.38 
 
 		 420 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  67.38 
 
 		 420 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  67.38 
 
 		 420 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  68.17 
 
 		 420 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  67.38 
 
 		 421 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  68.17 
 
 		 420 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  65.95 
 
 		 419 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  66.9 
 
 		 420 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  65.71 
 
 		 420 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  63.25 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  57.18 
 
 		 426 aa  521  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  57.93 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  44.23 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  45.11 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  43.03 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 		 431 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 		 404 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 		 401 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  32.53 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  30.98 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  29.72 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 		 400 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 448 aa  193  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  27.72 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.29 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 366 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  25.62 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  28.72 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.56 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  28.82 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 		 446 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 349 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  25.07 
 
 		 404 aa  136  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  25.77 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  24.94 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  28.28 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  25.77 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  24.55 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 		 386 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  23.83 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.38 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  27.02 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>