More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2459 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 400 aa  820    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  63.18 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  58.15 
 
 		 401 aa  488  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  59.5 
 
 		 401 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  59.5 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  57.86 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  59.5 
 
 		 401 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  58.25 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  58 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  58 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  59.15 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  58 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  58.5 
 
 		 401 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  56.76 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  55.58 
 
 		 398 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  55.8 
 
 		 404 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 419 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  35.69 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 		 420 aa  205  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  33.62 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 		 421 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 420 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 420 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  31.83 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  29.72 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  29.79 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  29.61 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  26.1 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 448 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.43 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.8 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 		 439 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 448 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  25.87 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  27.22 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  25.92 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  24.72 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  27.03 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  27.02 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  22.61 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.13 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  26.71 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  25.64 
 
 		 424 aa  99.4  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  22.56 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  23.43 
 
 		 395 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  36.96 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  26.37 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  27.55 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  24.05 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  24.17 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>