More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0845 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
429 aa  863    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  38.13 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  34.94 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 
413 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33.75 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
410 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 
411 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
431 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  35.48 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  33.97 
 
 
403 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
404 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
402 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  36.55 
 
 
402 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
406 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.58 
 
 
404 aa  226  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 
393 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.73 
 
 
395 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  35.35 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  36.97 
 
 
427 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  35.38 
 
 
372 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
400 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  28.31 
 
 
395 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
406 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
304 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 
401 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
416 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  27.35 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
304 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 
424 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 
420 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 
420 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
388 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
420 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  26.19 
 
 
420 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.93 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
402 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  25.67 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  24.45 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 
417 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
436 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  23.86 
 
 
400 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  28.67 
 
 
389 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  23.76 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  24.69 
 
 
401 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
431 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
435 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
417 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 
419 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
401 aa  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 
441 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  24.01 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  25.06 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  24.25 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  27.61 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 
394 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  23.23 
 
 
392 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  25.28 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  22.41 
 
 
391 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  24.03 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 
345 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  24.74 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  26.48 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  25.33 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  23.87 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  23.28 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  23.87 
 
 
411 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 
400 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0647  HD-GYP domain-containing protein  28.72 
 
 
340 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0194501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 
396 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
372 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>