More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2489 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 416 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  68.09 
 
 		 426 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  64.1 
 
 		 420 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  64.1 
 
 		 421 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  64.1 
 
 		 420 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  64.1 
 
 		 420 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  62.2 
 
 		 421 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  63.61 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  63.61 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  63.7 
 
 		 420 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  62.65 
 
 		 420 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  61.72 
 
 		 419 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  62.65 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  59.04 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  56.73 
 
 		 419 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  57.93 
 
 		 421 aa  498  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  42.72 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  42.36 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  42.26 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 		 431 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  31.87 
 
 		 401 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  31.62 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  31.01 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  28.37 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  28.54 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.37 
 
 		 409 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.72 
 
 		 403 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  25.9 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.08 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  27 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 410 aa  151  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.37 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.97 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.36 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  25 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 373 aa  137  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  25.55 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.17 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  26.54 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  27.06 
 
 		 488 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  26.43 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  29.51 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  26.02 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  22.96 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 369 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>