More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1519 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
404 aa  827    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  60.7 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  59.15 
 
 
404 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  58.58 
 
 
407 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  56.68 
 
 
401 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  56.68 
 
 
401 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  56.68 
 
 
401 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  56.68 
 
 
401 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  57.35 
 
 
402 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  56.93 
 
 
401 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  56.93 
 
 
401 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  58.23 
 
 
401 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  55.69 
 
 
401 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  55.56 
 
 
400 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  54.46 
 
 
406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  53.2 
 
 
398 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 
418 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 
419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
421 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
420 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
420 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
420 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  32.6 
 
 
420 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 
420 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 
420 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 
420 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 
421 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
420 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  31.81 
 
 
417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  30.44 
 
 
426 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  29.93 
 
 
416 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  30 
 
 
417 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
431 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
417 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 
448 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  27.52 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 
436 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 
435 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
411 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
439 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.72 
 
 
403 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 
406 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 
410 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
404 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  29.53 
 
 
414 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  28.49 
 
 
427 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
448 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
400 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  25.84 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  27 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.01 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  26.67 
 
 
395 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 
401 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  25.28 
 
 
429 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  25.36 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  26.28 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 
396 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
448 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 
319 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.08 
 
 
409 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 
396 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  28.69 
 
 
392 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 
394 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  23.72 
 
 
454 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
360 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.74 
 
 
390 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 
400 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
448 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
419 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>