More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2078 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  853    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  72.42 
 
 
417 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  72.38 
 
 
416 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  46.75 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  46 
 
 
421 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  45.67 
 
 
419 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 
419 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  44.52 
 
 
426 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  45.11 
 
 
421 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  43.91 
 
 
420 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 
420 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 
420 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  44.26 
 
 
420 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 
420 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 
421 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  43.44 
 
 
420 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  43.44 
 
 
420 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 
420 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  42.26 
 
 
416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 
431 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
417 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 
448 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 
435 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 
398 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  31.71 
 
 
446 aa  227  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  34.6 
 
 
448 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  32.93 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 
407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
454 aa  216  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 
404 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  32.26 
 
 
406 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
401 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
401 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
401 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
404 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
401 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
401 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
406 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  27.81 
 
 
403 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 
406 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
404 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 
410 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
402 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
364 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 
419 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.75 
 
 
409 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 
366 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 
401 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  26.67 
 
 
405 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 
439 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  24.25 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  29.62 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 
395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 
373 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  23.85 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.46 
 
 
412 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.33 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 
411 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  24.88 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  35.52 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  24.26 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 
399 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  24.29 
 
 
390 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 
362 aa  126  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
448 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
372 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 
393 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  27.32 
 
 
401 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 
352 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  24.66 
 
 
419 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  29.39 
 
 
421 aa  123  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  25.12 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  26.08 
 
 
401 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>