More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1942 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  100 
 
 		 420 aa  859    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  91.43 
 
 		 421 aa  789    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  91.67 
 
 		 420 aa  792    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  91.43 
 
 		 420 aa  789    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  94.76 
 
 		 420 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  91.67 
 
 		 420 aa  792    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  95 
 
 		 420 aa  820    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  90 
 
 		 420 aa  785    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  94.05 
 
 		 420 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  70 
 
 		 421 aa  618  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  66.19 
 
 		 418 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  65.57 
 
 		 419 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  66.9 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  62.92 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  63.7 
 
 		 416 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  61.03 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  42.51 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  44.26 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  41.55 
 
 		 416 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 		 404 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  29.1 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  30.81 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  31.54 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 		 401 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 		 436 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  26.08 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.94 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.8 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 		 411 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 		 429 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.24 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  26.08 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  26.24 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 		 388 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  25.32 
 
 		 402 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  23.31 
 
 		 431 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  25.18 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 		 424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  23.56 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.62 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  26.08 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  24.8 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 375 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  24.88 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  27.2 
 
 		 424 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 372 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>