More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1577 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  85.04 
 
 
401 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  89.53 
 
 
401 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  84.79 
 
 
401 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  99.5 
 
 
401 aa  821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
401 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  82.59 
 
 
402 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  85.04 
 
 
401 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  86.03 
 
 
401 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  98.25 
 
 
401 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  65.67 
 
 
401 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  63.25 
 
 
404 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  62.66 
 
 
407 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  57.35 
 
 
404 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  60.1 
 
 
400 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  57.92 
 
 
406 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  56.08 
 
 
398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
419 aa  226  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
421 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  31.39 
 
 
416 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  31.55 
 
 
417 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 
416 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  30.17 
 
 
426 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  29.78 
 
 
420 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
420 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 
420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 
420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  29.54 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
420 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
420 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
420 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
421 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
431 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
417 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 
448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  25.06 
 
 
446 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 
466 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.61 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  27.02 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.23 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 
402 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 
406 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
412 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
448 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 
448 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
377 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 
448 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 
410 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
366 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  24.64 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 
392 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 
401 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
396 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
350 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  25.68 
 
 
392 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  25.57 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  25.22 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
411 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
411 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
429 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 
411 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  25.91 
 
 
421 aa  113  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
353 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 
369 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 
400 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  25.51 
 
 
405 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 
403 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  27.96 
 
 
394 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 
419 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 
360 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4158  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
348 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  25.13 
 
 
424 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
396 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 
397 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  30.25 
 
 
1333 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  23.73 
 
 
413 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1725  metal dependent phosphohydrolase  41.79 
 
 
207 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
431 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
356 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 
400 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 
446 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  23.99 
 
 
395 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>