More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2795 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
357 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  45.38 
 
 
388 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  45.25 
 
 
385 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
360 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 
385 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  52.68 
 
 
358 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 
353 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 
349 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
351 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  36.34 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  36.34 
 
 
347 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 
362 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
364 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  34.57 
 
 
350 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  37.46 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  43.64 
 
 
350 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  40.87 
 
 
348 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
366 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 
368 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 
446 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.56 
 
 
358 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 
367 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 
304 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
439 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
436 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
431 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
419 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  34.48 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 
413 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.78 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  42.41 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  38.27 
 
 
401 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  44.59 
 
 
448 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.74 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
496 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  35.59 
 
 
414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
1073 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
402 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  42.42 
 
 
427 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
403 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 
412 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
345 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  39.88 
 
 
402 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  41.77 
 
 
401 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 
411 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
401 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  42.17 
 
 
452 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  38.41 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  41.29 
 
 
713 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0886  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.286498  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  41.67 
 
 
1333 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 
372 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  34.16 
 
 
395 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
364 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
652 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  42.95 
 
 
1313 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 
199 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  35.63 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  36.45 
 
 
1237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 
770 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  32.4 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
306 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
698 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  39.49 
 
 
339 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2589  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 
375 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0322399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
398 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  29.96 
 
 
405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 
393 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  29.18 
 
 
403 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
400 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.41 
 
 
487 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  43.05 
 
 
384 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  40.38 
 
 
718 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  38.65 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0111  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.153504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>