More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1721 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  90.71 
 
 		 420 aa  787    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  94.05 
 
 		 420 aa  811    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  93.81 
 
 		 421 aa  816    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  95.48 
 
 		 420 aa  824    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  95.71 
 
 		 420 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  93.57 
 
 		 420 aa  813    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  93.57 
 
 		 420 aa  813    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  93.81 
 
 		 420 aa  816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 420 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  69.05 
 
 		 421 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  66.59 
 
 		 418 aa  595  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  66.35 
 
 		 419 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  68.1 
 
 		 421 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  64.2 
 
 		 419 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  61.5 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  62.65 
 
 		 416 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  43 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  43.65 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  41.3 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 431 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 404 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  29.1 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  31.93 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  30.83 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 		 401 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 466 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.57 
 
 		 390 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  27.07 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 		 406 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  26.27 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  25.93 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 350 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 		 366 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  25.32 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  22.61 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  23.84 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  25.19 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  27.13 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.1 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  23.13 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  24.1 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  26.33 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  26.33 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  26.92 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  26.08 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  25.41 
 
 		 395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>