More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0570 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 417 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  44.42 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  36.59 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 418 aa  289  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  37.21 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  35.56 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 		 420 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 		 435 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 		 420 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 		 420 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  37.14 
 
 		 420 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 420 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 419 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 420 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  34.81 
 
 		 416 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 420 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  35.28 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  34.69 
 
 		 426 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 		 448 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  37.92 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 		 404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 		 439 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  30.1 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  28.61 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 436 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  31.54 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.12 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.49 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  29.04 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.34 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.69 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  28.82 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  26.65 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0251  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 478 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000543923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.36 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0235  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 377 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  29.53 
 
 		 421 aa  126  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  28.93 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  33.49 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  29.41 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.94 
 
 		 488 aa  123  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  25.07 
 
 		 405 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>