More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0063 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
404 aa  825    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  36.34 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  35.5 
 
 
409 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  36.09 
 
 
402 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 
413 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
403 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  36.91 
 
 
427 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.16 
 
 
404 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.24 
 
 
401 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  37.56 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
411 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 
410 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  34.17 
 
 
403 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 
431 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 
404 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  33.02 
 
 
419 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  33.83 
 
 
410 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
402 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
419 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
406 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
406 aa  222  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.15 
 
 
399 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.24 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
377 aa  212  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
412 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  33.42 
 
 
388 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 
398 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 
401 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
424 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
386 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
372 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
395 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
402 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  30.29 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 
439 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  30.34 
 
 
392 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
400 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
392 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
413 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
396 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
401 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
394 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
396 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 
400 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  30.97 
 
 
395 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
396 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
396 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
396 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
405 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.19 
 
 
390 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
448 aa  179  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
395 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  28.74 
 
 
403 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
398 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  31.13 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  31.79 
 
 
488 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 
441 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 
372 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
448 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
391 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  31.02 
 
 
405 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
401 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
417 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
389 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 
364 aa  160  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 
304 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 
369 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 
435 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
304 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
435 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
350 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
369 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  27.42 
 
 
424 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  29.55 
 
 
443 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
349 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 
516 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 
319 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  35.89 
 
 
367 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
448 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  24.25 
 
 
431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 
356 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
373 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
370 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>