More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1822 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 395 aa  816    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  69.6 
 
 		 413 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  47.63 
 
 		 403 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  46.38 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  46.29 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  43.99 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  43.62 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  42.89 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  41.88 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  39.29 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.23 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  40.2 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 419 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  40.15 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  38.4 
 
 		 413 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 		 431 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  37.73 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  39.2 
 
 		 409 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  39.14 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  38.11 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  36.39 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 372 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 		 439 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 		 304 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 404 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 412 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.39 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.51 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  29.54 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  28.34 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 		 390 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  28.5 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  27.81 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  28.38 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  27.2 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30.81 
 
 		 424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  27.39 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  35.86 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 420 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  27.35 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 		 350 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  26.08 
 
 		 435 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  31.64 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>