More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2829 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  77.3 
 
 
304 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
446 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  38.3 
 
 
409 aa  234  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  38.39 
 
 
414 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  38.34 
 
 
401 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.87 
 
 
410 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  37.39 
 
 
404 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 
419 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  37.23 
 
 
427 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  36.83 
 
 
411 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
419 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  38.05 
 
 
402 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  35.24 
 
 
413 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 
372 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
319 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
402 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 
431 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
413 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
395 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  34.45 
 
 
403 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.44 
 
 
395 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
406 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
393 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.17 
 
 
419 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
399 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
386 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 
400 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 
401 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
402 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
424 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 
439 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
411 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
400 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
411 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 
392 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  31.65 
 
 
394 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
404 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 
390 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
396 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.19 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 
396 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 
401 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
406 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
429 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.81 
 
 
390 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 
396 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
398 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
402 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 
396 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 
394 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 
396 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
391 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 
396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
398 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 
395 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  34.63 
 
 
405 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 
357 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  27.58 
 
 
401 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
448 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  37.57 
 
 
403 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  32.51 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
364 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 
412 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  36.28 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
389 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30.87 
 
 
424 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  26.93 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
448 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.54 
 
 
410 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
373 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  28.53 
 
 
395 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  31.3 
 
 
443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 
350 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
369 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 
356 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
436 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  40.48 
 
 
352 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0746  metal dependent phosphohydrolase  41.25 
 
 
384 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.35 
 
 
491 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 
418 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
201 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
436 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
366 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
349 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>