More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2807 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
419 aa  863    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  70.64 
 
 
421 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  65.16 
 
 
418 aa  594  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  65.64 
 
 
420 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  66.35 
 
 
420 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  65.88 
 
 
420 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  65.88 
 
 
420 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  66.35 
 
 
420 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  66.35 
 
 
421 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  65.57 
 
 
420 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  66.11 
 
 
420 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  66.11 
 
 
420 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  65.95 
 
 
421 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  62.74 
 
 
419 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  61.72 
 
 
416 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  60.09 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  44.9 
 
 
417 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  41.59 
 
 
416 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  41.2 
 
 
417 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 
417 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
401 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  32.36 
 
 
404 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 
402 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 
401 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
398 aa  223  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
401 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
401 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
401 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
400 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  32.68 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 
454 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  31.19 
 
 
406 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
435 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  27.52 
 
 
446 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
439 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
466 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
401 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
448 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
448 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.8 
 
 
390 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 
395 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 
377 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 
410 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
406 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 
419 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 
436 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.17 
 
 
404 aa  153  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 
406 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 
404 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  26.17 
 
 
409 aa  150  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  27.27 
 
 
403 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
424 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  28.02 
 
 
427 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  25.92 
 
 
431 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
399 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
419 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
411 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
366 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 
413 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 
400 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  24.88 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 
446 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 
413 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.42 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  26.21 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  24.94 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
350 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  27.58 
 
 
369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  27.6 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  26.16 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  24.86 
 
 
424 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 
435 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 
396 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  24.09 
 
 
403 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
394 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
369 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
395 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  27.68 
 
 
394 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
396 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 
386 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 
388 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
396 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
353 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
398 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>