More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3755 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
435 aa  898    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  38.9 
 
 
441 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
406 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 
448 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
448 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.54 
 
 
390 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
439 aa  196  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  29.58 
 
 
424 aa  189  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  31.07 
 
 
488 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
435 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
401 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
402 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33.96 
 
 
409 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 
393 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
412 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
413 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
395 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0622  alkaline phosphatase  27.87 
 
 
439 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.898935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  26.05 
 
 
410 aa  163  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
349 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  32.41 
 
 
395 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
419 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
424 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
431 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  35.83 
 
 
403 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 
399 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
419 aa  156  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
364 aa  156  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
406 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
404 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  30.04 
 
 
401 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  34.73 
 
 
372 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  30.86 
 
 
402 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 
369 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  32.42 
 
 
427 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
377 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  32.02 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
388 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
377 aa  146  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  27.12 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 
398 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  24.83 
 
 
403 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 
364 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 
370 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
446 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 
373 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  25.43 
 
 
404 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 
386 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
389 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 
350 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
373 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
366 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  27.84 
 
 
421 aa  139  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
457 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  30.89 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 
356 aa  136  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
395 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  26.41 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 
400 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  25.06 
 
 
400 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  24.41 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 
413 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 
345 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  23.02 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.69 
 
 
632 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  23.95 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  26.35 
 
 
394 aa  128  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  23.95 
 
 
396 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  23.95 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  29.18 
 
 
453 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
429 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
446 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
448 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
346 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
353 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  23.95 
 
 
396 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 
419 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  24.9 
 
 
389 aa  126  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2262  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
275 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114746  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 
420 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 
411 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>