More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2785 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
448 aa  898    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  48.52 
 
 
454 aa  362  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  42.63 
 
 
446 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  41.91 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 
466 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 
431 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 
417 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  34.36 
 
 
417 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
418 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
420 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
420 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
420 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
420 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
421 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
420 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  32.54 
 
 
420 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  28.95 
 
 
416 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  29.52 
 
 
417 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
419 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  31.22 
 
 
426 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 
416 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
398 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  29.97 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  26.68 
 
 
406 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
401 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
401 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
402 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
439 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 
401 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 
402 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
435 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
395 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  26.09 
 
 
409 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.42 
 
 
403 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
406 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 
400 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  32.5 
 
 
488 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
404 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  27.76 
 
 
446 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  27.94 
 
 
405 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 
412 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 
394 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 
395 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  29.61 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  28.05 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 
402 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 
379 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  29.75 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  30.04 
 
 
448 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 
396 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
436 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.49 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
411 aa  96.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 
448 aa  96.3  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  23.4 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  25.13 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  28.88 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.74 
 
 
401 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2262  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
275 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114746  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 
392 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
388 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
401 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.07 
 
 
390 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
398 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 
377 aa  91.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30.2 
 
 
424 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.01 
 
 
404 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  27.43 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  24.08 
 
 
413 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  24.86 
 
 
395 aa  89  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 
369 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  22.63 
 
 
390 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>