More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2262 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2262  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
275 aa  557  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114746  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  36.74 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 
341 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
393 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  29.92 
 
 
388 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
402 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
403 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
431 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  32.92 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
411 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.16 
 
 
404 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  28.63 
 
 
401 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.8 
 
 
409 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
419 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  35.1 
 
 
401 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 
424 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  31.01 
 
 
427 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  32.94 
 
 
389 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.6 
 
 
395 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
390 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
400 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 
410 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 
412 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 
395 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  29.04 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  29.84 
 
 
414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 
413 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
401 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
435 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
417 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
448 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  29.25 
 
 
392 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  28.83 
 
 
410 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
392 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  29.62 
 
 
405 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
404 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  30.95 
 
 
453 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
406 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 
436 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  29 
 
 
403 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 
404 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
394 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  29.58 
 
 
403 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  32.2 
 
 
395 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
411 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  30.12 
 
 
419 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 
446 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  28.85 
 
 
394 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
400 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 
516 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 
360 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
396 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
396 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 
448 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 
402 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
457 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 
400 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
436 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
429 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
375 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
413 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
359 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
373 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
439 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.94 
 
 
390 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  29.46 
 
 
443 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 
448 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
436 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
369 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  25.6 
 
 
421 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
414 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  33.12 
 
 
352 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
479 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 
379 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
364 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
406 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3932  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
360 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
395 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>