More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7866 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  67.13 
 
 		 364 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  62.95 
 
 		 362 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  59.78 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  61.62 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  58.15 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  58.97 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  52.86 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  35.63 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  48.83 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  38.15 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 		 347 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  35.9 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  37.46 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  43.06 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  43.06 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  42.41 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  43.67 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  41.51 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  33.19 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  32.03 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 713 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  37.97 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.99 
 
 		 496 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  39.62 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  38.99 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 		 698 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2864  two-component response regulator  29.43 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384945  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 1073 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  38.37 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  33.18 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  33.49 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  31.39 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  39.62 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  29.91 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  38.04 
 
 		 740 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 		 212 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 		 1171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  37.74 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  32.57 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  36.76 
 
 		 1237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 710 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  44.09 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 		 481 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2370  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  29.87 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  29.27 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.67 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 		 736 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  38.99 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 448 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 651 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 414 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>