More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3942 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 351 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  87.28 
 
 		 347 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  86.71 
 
 		 347 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  55.3 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  54.2 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  39.14 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 		 350 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  50.23 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  36.34 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  37.28 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  43.32 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  48.31 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  41.54 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  41.23 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.58 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  38.01 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  35.48 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33.8 
 
 		 409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  38.04 
 
 		 419 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  35.76 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 401 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 		 420 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 424 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.03 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  37.35 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 470 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  38.37 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  31.36 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  39.08 
 
 		 876 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  43.66 
 
 		 651 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 562 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 448 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  30.36 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 		 411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 		 698 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  36.47 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 		 558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 861 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  39.39 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 713 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 196 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 		 496 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  36.84 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 		 1073 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 505 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>