More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4035 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 364 aa  732    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  82.04 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  67.13 
 
 		 369 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  64.93 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  63.76 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  63.48 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  64.25 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 		 360 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  37.31 
 
 		 348 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  41.48 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  39.83 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  50.7 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  35.94 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  52.69 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  47.89 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  47.42 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  46.95 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  39.62 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  35.6 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  35.81 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  36.88 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  42.76 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  35.19 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 		 713 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  36.87 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  37.5 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 698 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  36.25 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 1073 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  34.91 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  35.62 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 		 562 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  36.41 
 
 		 740 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 		 414 aa  109  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  34.29 
 
 		 509 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 		 1237 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 		 651 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  44.53 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  35.47 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 1171 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2864  two-component response regulator  28.57 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384945  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 		 710 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  41.61 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.15 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  30.37 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 685 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2370  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  35.36 
 
 		 1333 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 736 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  31.38 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>