More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6715 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 358 aa  695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  66.67 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  46.74 
 
 		 385 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  45.25 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  41.93 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  40.57 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  46.71 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  39.82 
 
 		 369 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  50.93 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  44.28 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  44.28 
 
 		 347 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  51.85 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.45 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  39.31 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.38 
 
 		 368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  42.92 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.84 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  44.75 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.34 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  44.03 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  42.96 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  42.6 
 
 		 574 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  43.66 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  39.07 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 470 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 		 471 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 		 562 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 446 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  35.05 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.73 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  42.95 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  39.67 
 
 		 740 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  38.22 
 
 		 247 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 505 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  30.72 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  34.53 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 		 565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 		 196 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 698 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 713 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.98 
 
 		 508 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  42.68 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 		 545 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  35.05 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  41.25 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  30.7 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  39.87 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  44.29 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 1073 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  39.86 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.2 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  34.02 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 		 491 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0111  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 228 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.153504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 770 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  42.41 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  49.57 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.77 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 615 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  41.14 
 
 		 792 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.51 
 
 		 841 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 		 736 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.4 
 
 		 880 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  31.32 
 
 		 563 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.4 
 
 		 860 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 648 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 		 618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>