More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5693 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
350 aa  703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  46.69 
 
 
354 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.3 
 
 
358 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  39.89 
 
 
350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  43.62 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  40.75 
 
 
353 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  51.85 
 
 
358 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 
349 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  41.6 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  38 
 
 
369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.28 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  38.48 
 
 
362 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 
388 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  44.05 
 
 
385 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  40 
 
 
348 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  43.64 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.55 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
368 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
368 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  42.61 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 
410 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 
740 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  41.98 
 
 
453 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  37.99 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  40.23 
 
 
448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
412 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  38.01 
 
 
388 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  39.16 
 
 
319 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  38.64 
 
 
650 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  36.16 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 
436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
424 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 
420 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 
345 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 
450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  43.83 
 
 
868 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
487 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 
398 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  27.99 
 
 
390 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  38.18 
 
 
419 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
439 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  36.36 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  37.27 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  43.21 
 
 
861 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
399 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 
558 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 
1237 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
320 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
448 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
446 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
1073 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 
470 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 
369 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
400 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
343 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
199 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.42 
 
 
1171 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.74 
 
 
345 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  38.99 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  41.92 
 
 
1333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3561  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.878767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  40.14 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  35.71 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
649 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  42.22 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  39.01 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 
197 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
212 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  29.26 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
572 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
562 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 
428 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 
483 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  31.27 
 
 
365 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
354 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 
411 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  40.51 
 
 
428 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>