More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0917 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 353 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  80.69 
 
 		 349 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  55.3 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  54.52 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  54.23 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  39.48 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  42.06 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  37.75 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  40.75 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  51.94 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 364 aa  192  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  38.87 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  41.39 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  42.86 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  42.55 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 410 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 413 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 		 431 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  37.33 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  35.98 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  41.32 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 		 436 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  34.14 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2589  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0322399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.96 
 
 		 395 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  35.55 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 401 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  42.77 
 
 		 771 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 		 417 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  37.13 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  35.61 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  42.96 
 
 		 651 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  32 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  36.14 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  32.6 
 
 		 427 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  28.34 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  42.75 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  27.39 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  30.18 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  34.81 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1333 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  41.73 
 
 		 436 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  37.42 
 
 		 465 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  29.21 
 
 		 410 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1200  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 203 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  0.101307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.87 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2330  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541081  normal  0.158055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.48 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>