More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4291 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  99.74 
 
 
385 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
385 aa  760    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  87.82 
 
 
388 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 
360 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 
357 aa  262  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  59.17 
 
 
358 aa  252  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  39.44 
 
 
350 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  43.21 
 
 
350 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 
353 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  40.06 
 
 
351 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 
347 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  38.2 
 
 
347 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.95 
 
 
364 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  42.59 
 
 
369 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 
358 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  48.19 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  39.81 
 
 
348 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 
368 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 
366 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 
368 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
367 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 
436 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 
446 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 
412 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  39.79 
 
 
442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33.18 
 
 
409 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
345 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 
419 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 
400 aa  126  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  34.42 
 
 
389 aa  125  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
350 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 
496 aa  125  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
417 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 
393 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 
419 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
304 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
395 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  41.61 
 
 
448 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 
319 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  41.36 
 
 
410 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
399 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  40.59 
 
 
453 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
304 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  33.96 
 
 
352 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  31.94 
 
 
410 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  39.75 
 
 
419 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 
196 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  42.26 
 
 
1237 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2484  metal dependent phosphohydrolase  39.63 
 
 
723 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  43.12 
 
 
331 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
401 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 
1073 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  35.96 
 
 
395 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
448 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 
372 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 
461 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 
461 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.05 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  40.99 
 
 
448 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  36.02 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  39.75 
 
 
427 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  43.95 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  39.75 
 
 
414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 
386 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 
377 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2492  metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 
195 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  40.79 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  37.5 
 
 
212 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
391 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  43.51 
 
 
574 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
736 aa  116  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
298 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  37.66 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  32.76 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  36.97 
 
 
599 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 
534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  44.67 
 
 
771 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  41.51 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.66 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  41.72 
 
 
1333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.6 
 
 
1171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
306 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>