More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4706 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 368 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  85.05 
 
 		 368 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  79.08 
 
 		 367 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  65.41 
 
 		 366 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  63.76 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  58.15 
 
 		 369 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  60.91 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  44.29 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  34.01 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  43.26 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  32.58 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  34.49 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 		 351 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  29.86 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  37.56 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  37.09 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 419 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.91 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  28.15 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  27.06 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.38 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  28.77 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  34.69 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  33.12 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 		 431 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 404 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  33.99 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  29.95 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 698 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 196 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.06 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  35.82 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 		 1073 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  31.75 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.81 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 		 713 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 		 1313 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  30.41 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  37.72 
 
 		 550 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>