More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2714 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
318 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  54.09 
 
 
320 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  51.11 
 
 
316 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  52.2 
 
 
320 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  50.79 
 
 
316 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 
317 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 
320 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  42.26 
 
 
320 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  43.52 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 
335 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
338 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
328 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  34.98 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
413 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 
403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  34.45 
 
 
401 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
404 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 
393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  33.48 
 
 
403 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
446 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
372 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 
411 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  27.03 
 
 
403 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.67 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 
545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 
396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  32 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
319 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  33 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2293  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
394 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
395 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33 
 
 
409 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32 
 
 
404 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
396 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  29.01 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
396 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 
424 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
369 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
398 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  31.53 
 
 
405 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.27 
 
 
394 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  33.99 
 
 
419 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.26 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
618 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  32.04 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
396 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
320 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 
615 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
199 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
419 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
400 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
350 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
401 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
196 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  41.48 
 
 
349 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
373 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  27.78 
 
 
392 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 
432 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
339 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
401 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
392 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  30.04 
 
 
448 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  33.71 
 
 
311 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 
406 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
412 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 
389 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
351 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
397 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 
487 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  33.14 
 
 
836 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
1313 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  37.95 
 
 
212 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
364 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
350 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
718 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>