More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0887 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 320 aa  663    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  97.19 
 
 		 320 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  65.31 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 		 320 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 318 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  43.28 
 
 		 316 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 		 327 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 		 403 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.83 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  37.5 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 		 424 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 356 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 411 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2293  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  34.25 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 304 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 370 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.05 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 436 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 431 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  37.02 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 		 413 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  33.85 
 
 		 427 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  33.85 
 
 		 414 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  40.44 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  31.94 
 
 		 409 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 547 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 547 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 		 508 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 407 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  34.95 
 
 		 470 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  34.25 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 719 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 396 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 		 247 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 		 1171 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 345 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 		 390 aa  99  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 392 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 394 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 496 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.37 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 565 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>