More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3495 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 320 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  72.5 
 
 		 320 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  59.18 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  58.54 
 
 		 316 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  54.09 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  46.3 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 		 320 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  44.59 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  28.73 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  32.14 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 411 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 		 410 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  31.94 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 467 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 		 545 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  36.79 
 
 		 402 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.69 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.16 
 
 		 401 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 		 436 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  41.91 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.15 
 
 		 404 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5280  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.273072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 199 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 388 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  32.29 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 		 370 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.91 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 868 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  25.94 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 		 618 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3786  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 456 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2370  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  32.77 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 		 346 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 364 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 615 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  33.93 
 
 		 405 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 648 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  38.13 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  36.3 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  26.79 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.11 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  31.03 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  28.63 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  33.93 
 
 		 718 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 651 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  30.23 
 
 		 392 aa  99.8  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  30.09 
 
 		 403 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 406 aa  99.4  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 647 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 547 aa  99.4  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 547 aa  99.4  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 350 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>