More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2625 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
321 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  65.31 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  65 
 
 
320 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  43.52 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  43.45 
 
 
316 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  43.45 
 
 
316 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 
320 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  42.26 
 
 
317 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
335 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 
338 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 
328 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
327 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
413 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
370 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 
424 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.13 
 
 
404 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 
369 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.98 
 
 
401 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
399 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  40.12 
 
 
402 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  32.38 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  32.57 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 
419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  34.9 
 
 
427 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32 
 
 
409 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
403 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  36.63 
 
 
414 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
402 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
412 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2293  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
364 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
419 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
304 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 
373 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
413 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
356 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
372 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
350 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  40.28 
 
 
373 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
424 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
390 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
395 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 
377 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 
395 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  37.35 
 
 
469 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  29.63 
 
 
419 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
353 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
367 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
400 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 
377 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 
401 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
446 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  26.97 
 
 
332 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  36.14 
 
 
509 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 
407 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  24.13 
 
 
410 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
345 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
411 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
366 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
402 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 
436 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
421 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 
417 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 
387 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
350 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
420 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 
401 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 
450 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 
391 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
420 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
362 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0746  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
384 aa  99.4  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 
618 aa  99  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 
319 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
432 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 
320 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  28.35 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 
496 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
606 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
451 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  31.58 
 
 
424 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
452 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  41.91 
 
 
453 aa  96.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.94 
 
 
1171 aa  97.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>